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El manejo de semillas a pequeña escala es un área de estudio marginal, sin embargo es una fuente inagotable de variabilidad genética y conocimientos tradicionales. Por ser Phaseolus lunatus un cultivo subutilizado en Cuba, el objetivo del presente trabajo fue determinar la variabilidad morfo-agronómica de las poblaciones presentes en el país, y como ella es manejada y conservada in situ por  las comunidades rurales. Para ello se caracterizaron 55 accesiones, procedentes de las regiones occidental (10), central (15) y oriental (30), utilizando 30 descriptores morfo-agronómicos. Se utilizó el Análisis de Conglomerado con el cálculo de la distancia euclidiana (D) con el objetivo de observar como se agrupaban por su similitud (S=1-D) las diferentes accesiones evaluadas. De acuerdo a las similitudes encontradas entre las accesiones analizadas se definieron seis grupos morfoagronómicos, con características distintivas entre ellos. Además se analizó la información sobre el manejo del cultivo, tomada durante las entrevistas realizadas a las familias de las fincas. Se demuestra la existencia de una variabilidad infraespecífica del cultivo de Phaseolus lunatus en Cuba, que los campesinos han mantenido, conservado y manejado hasta nuestros días a través de su uso, y no ha sido explotada comercialmente hasta el presente, a pesar de poseer buen comportamiento para algunas características productivas.